میکروسکوپ های الکترونی عبوری (TEM) پرتوهای تشکیل دهنده تصویر را از نمونه مشاهده شده عبور می دهند. برای تجزیه و تحلیل نمونه از تصاویر پرتوهای کنتراست یا پراش استفاده می شود.

دیگر میکروسکوپ الکترونی فهرست نشده.

میکروسکوپ را می توان از راه دور با رایانه از طریق رابط کنترل یا نظارت کرد.

میکروسکوپ دارای نرم افزار کاربردی برای کنترل یا تجزیه و تحلیل تصاویر است.

این میکروسکوپ مجهز به یک محفظه محیطی است که به آن امکان می دهد اختلاف فشار را بین سطوح خلاء بالا مورد نیاز در ناحیه تفنگ و ستون و فشارهای نسبتاً پایین مورد استفاده در محفظه حفظ کند. این امکان به این معنی است که می‌توان از میکروسکوپ برای بررسی نمونه‌های بدون پوشش مانند نوع مواد، حشرات سنجاق‌شده، نمونه‌های کانی‌شناسی و فسیل‌ها استفاده کرد. میکروسکوپ های الکترونی فشار متغیر اجازه می دهند که فشار در محفظه نمونه در سطح بسیار بالاتری نسبت به SEM های معمولی حفظ شود. وجود مولکول های هوا (یا گاز بی اثر) در محفظه دو اثر عمده دارد. اولا، گازهای خروجی از نمونه هایی که هیدراته یا روغنی هستند را به میزان قابل توجهی کاهش می دهد. این اجازه می دهد تا این نوع نمونه ها بدون نیاز به آماده سازی نمونه های پیچیده، مانند خشک کردن انجمادی یا خشک کردن نقطه بحرانی و غیره مورد بررسی قرار گیرند. دومین مزیت مهم این است که مولکول های هوا همچنین به دفع تجمع بار روی سطح نارسانا کمک می کنند. نمونه ها، به این معنی که دیگر نیازی به پوشاندن آنها با یک لایه رسانا قبل از بررسی نیست.